Rei ist die erste von Marduk ausgewählte Children und Pilotin von EVA-00. Sie umgeben viele Geheimnisse da ihre gesamte Vergangenheit gelöscht wurde. Rei zeigt selten Gefühle und vieles ist ihr gleichgültiger als Shinji. Man kann erkennen das Rei Ähnlichkeit mit Shinjis verstorbener Mutter Yui hat was sich später als ein wichtiger Faktor herausstellt. Schon bald zeigt sich, daß Rei sich nicht nur vom Charakter stark von anderen Menschen unterscheidet. Sie spürt, daß sie anders ist als die anderen, aber als sie versucht, die Ursache dafür zu ergründen, stößt sie schnell in die Abgründe ihrer eigenen Seele vor. Das Mädchen ist fester Bestandteil des "Human Instrumentality Projects", denn sie ist ein Klon Yui Ikari und besitzt gleichzeitig Fähigkeiten, die eher auf einen Engel schließen lassen, da in ihrem Körper ein Teil der Seele von Lilith steckt. Rei hat wenig Kontakt zu anderen Menschen. Sie lebt allein in einer trostlosen Blockbauwohnung und kommt nur selten zur Schule, da sie regelmäßig von Gendo zu Testzwecken abgezogen wird. Ähnlich wie Shinji tut sie alles, was man ihr befielt, und zwar wortwörtlich. Sie haßt Gendo, weil er sie benutzt, fühlt sich ihm jedoch gleichzeitig verbunden, da er sie erschaffen hat. Während Asuka Rei zutiefst haßt, gelingt es Shinji bisweilen, sich einen Weg in das verschlossenen Mädchen zu bahnen. Er rettet ihr mehrmals das Leben und weckt damit scheinbar die mütterlichen Gefühle von Yui in ihr. Als Rei in End of Evangelion mit Lilith verschmilzt lässt sie Gendo zurück, erfüllt Shinjis größten Wunsch und vernichtet damit die Menschheit.

Asuka wurde in Deutschland geboren und erlebte eine kurze glückliche Kindheit, bis ihr Vater ihre Mutter verließ. Diese konnte den Verlust nicht verkraften und erlitt einen Nervenzusammenbruch bis schließlich Selbstmord begann. Asuka kam zu Pflegeeltern und schwor sich, nie mehr zu weinen, so verbittert war sie darüber, daß ihre Mutter sie im Stich gelassen hatte. Als in NERV Dependance 3 in Deutschland EVA 02 gebaut wurde, erwählte man Asuka als Pilotin. Ehrlich gesagt... Asuka hat einen miesen Charakter und ein vollkommen übersteigertes Selbstbewußtsein: Sie hält sich für schöner, klüger und vor allem besser als Shinji und Rei. Während sie Rei auf den Tod nicht ausstehen kann, nimmt sie den armen Shinji ständig auf's Korn. Soryu kann es nicht ausstehen, wenn andere bessere Leistungen bringen als sie, und als Shinjis Synchrorate über die ihre steigt, verliert sie fast den Verstand. Mögen tut sie jedoch niemanden wirklich. Später wird immer klarer, daß sie auch sich selbst abgrundtief haßt und EVA vor allem deshalb steuert, weil sie sich selbst beweisen muß, daß ihr Leben einen Sinn hat. Hinter Asukas Verhalten steckt jedoch ein tiefes seelisches Trauma, ausgelöst durch den Selbstmord ihrer Mutter. Der Engel Arael holt mit seiner Psycho-Attacke diese verdrängten Erinnerungen aus ihrer Seele hervor und zerbricht Asuka damit so sehr, daß sie immer unzugänglicher wird und ihre Synchrowerte unter Null sinken. Man versucht vergeblich sie wieder auf den rechten Weg zu bringen-ohne Erfolg. Sie fällt durch diese Versuche sogar in ein tiefes Koma. Erst in End of Evangelion erwacht sie und ist wieder in der Lage, EVA-02 zu steuern.

Shinji ist die Hauptfigur in NGE. Er hat eine traurige Kindheit hinter sich: Seine Mutter kam bei einem Unfall mit EVA 01 ums Leben, als Shinji 3 Jahre alt war. Daraufhin wurde er von seinem Vater zu seinem Lehrer geschickt, um in dessen Haushalt aufzuwachsen. Gendo Ikari kümmerte sich praktisch nicht mehr um seinen Sohn, und Shinji, der ihn abgrundtief zu hassen begann, kapselte sich immer mehr von seiner Umwelt ab. Heute, im Alter von 14 Jahren, ist er ein schüchterner, introvertierter Einzelgänger, der große Schwierigkeiten im Umgang mit anderen Menschen hat und sich deshalb alleine auch wesentlich wohler fühlt. Sein ganzes Leben wird umgekrempelt, als ihn sein Vater zu sich nach Neo-Tokyo-3 holt - keineswegs, um endlich das, was er seinem Sohn angetan hat, wieder gut zu machen, sondern, um ihn als Pilot von EVA 01 einzusetzen. Shinji wohnt von diesem Tag an in Misatos Wohnung, die für ihn nicht nur den Aufpasser und Vorgesetzten spielt, sondern auch eine Art Ersatzmutter im weitesten Sinne ist. Es fällt ihm schwer, Freundschaften zu knüpfen, und selbst die zarten Bande zu Rei, Toji oder Kensuke bleiben eher lose. Im Verlauf der letzten Episoden und der anschließenden Movies wird aus dem gehorsamen Kind Shinji langsam ein junger Erwachsener, der die unvorstellbaren Ausmaße des "Human Complementation Project" und die Pläne seines Vaters durchschaut und alles daran setzt, die Menschheit vor dem Third Impact zu bewahren, zumal er allein durch das Steuern der EVAs einen Sinn in seinem Leben sieht. Während er früher mehr oder weniger untätig dahindämmerte, muß er nun plötzlich mit einer schweren Verantwortung klarkommen, für die er - wie auch die anderen Children - eigentlich noch viel zu jung ist...

Wie alle Children hat Toji keine Mutter, und sein Vater und Großvater haben alle Hände voll zu tun, so daß er alleine für seine kleine Schwester verantwortlich ist. Das funktioniert so lange ganz gut, bis Shinji bei seinem Kampf gegen den 3. Engel unabsichtlich mehrere Hochhäuser demoliert und Tojis Schwester durch herabstürzende Trümmer verletzt wird. Sie liegt während der gesamten Serie im Krankenhaus, wo Toji sie jeden Tag besucht. Es versteht sich von selbst, daß er stocksauer auf den Piloten von EVA 01 ist bis Shinji sein Leben vor einen weiteren Engel bewahrt. Toji gibt sich gerne als harter Bursche, und manchmal ist er ziemlich verrückt. Aus irgendeinem Grund trägt er anstelle seiner Schuluniform lieber einen Jogginganzug. Zusammen mit seinem Kumpel Kensuke freundet er sich trotz der anfänglichen Schwierigkeiten schließlich mit Shinji an und formt zusammen mit den beiden das "Idiotentrio". Die Piloten von EVA - insbesondere Asuka - sind ihm irgendwie suspekt. Er ist der Ansicht, daß nur merkwürdige Typen für diesen Job ausgewählt werden. Insgesamt hält er ziemlich wenig von NERV und ihren Kampfmaschinen, obwohl er natürlich weiß, daß sie alleine zwischen den Engeln und der Menschheit stehen. Entsprechend geschockt ist er, als er erfährt, daß man ihn als Pilot von EVA 03 ausgewählt hat. Im Gegensatz zu Asuka ist er alles andere als stolz darauf, und so verheimlicht er sowohl Shinji als auch Kensuke seine neue Berufung. Während des Testlaufes mit EVA 03 in einer Kleinstadt in der Nähe von Tokyo stellt sich heraus, daß der Roboter von einem Engel besessen ist. Nachdem EVA 03 vollkommen zerstört wurde, erfährt Shinji mit Entsetzen, daß Toji in dem Ding saß und bei dem Kampf schwere Verletzungen davontrug. Der hochgewachsene Toji kann ausgesprochen erwachsen und verantwortungsbewußt sein, wenn er will.

Im Gegensatz zu Shinji, Asuka oder Rei hat Kaworu keine traumatische Kindheit hinter sich, und er hat auch keinerlei Kontaktschwierigkeiten im Umgang mit anderen. Im Gegenteil, er ist ein sehr offener Charakter, der fast ununterbrochen lächelt und seine Umgebung aufmerksam beobachtet. Obwohl er hin und wieder etwas naiv wirkt, besitzt er doch für einen Jungen in seinem Alter eine beeindruckende Menschenkenntnis. Er philosophiert gern und kennt zahlreiche Weisheiten über das Leben und Streben der Menschen oder "Lilim", wie er sie zu nennen pflegt. Obwohl er ein Engel ist, wünscht er sich nicht wirklich das Ende der Menschheit. Kaworu ist eine durch und durch fröhliche Person. Er kann aber durchaus einen sehr ernsten und traurigen Gesichtsausdruck aufsetzen, wenn es die Situation erfordert. Dennoch opfert er sich für die Menschheit und insbesondere für Shinji, als er erkennt, daß SEELE ihn nur benutzen wollte, um ihn zur Verschmelzung mit Lilith zu bewegen, von der er dachte, sie wäre Adam. Denn Kaworu ist - wie alle Engel - aus Adam entstanden und verspürt den Drang, zu ihm zurückzukehren. Dies aber würde den Third Impact auslösen und das will er ja wie gesagt nicht. Kaworu sagte mal zu Rei: "Du bist wie ich.". Er wollte ihr mit diesen Worten sagen das er, ebenso wie sie ein Engel ist, der in einem künstlich erschaffenen menschlichen Leib steckt. Rei war über das mehr als verwirrt.