Das Gründungsdatum und die Herkunft von SEELE ist unbekannt. Diese Organisation wurde schon vor sehr langer Zeit gegründet und wusste bereits von der Ankunft der Engel. Die Dead Sea Scrolls sind SEELES strengst gehütetes Geheimnis, eine Prophezeiung in Hebräisch niedergeschrieben schließt auf das Schicksal der Menschheit. SEELES Aktionen sind streng geheim. Ihr Ziel mit der höchsten Priorität ist das Human Instrumentality Project. Nur Gendo Ikari , Kozo Fuyutsuki und die SEELE Mitglieder wissen über das HI Project bescheid. In diesen Project geht es darum die Menschheit vor dem Aussterben zu bewahren und sie zum Gott zu machen. Um dieses Project in die Tat umzusetzen ist SEELE nix zu schade um die Prophezeihung zu erfüllen.

Leiter der Organisation: Keel Lorenz

-Kommandant Gendo Ikari muss Lorenz Rechenschaft ablegen.
-SEELE ist deswegen die Organisation die NERV übergeordnet ist.
-Alle Mitglieder des Komitees sind hohe Persönlichkeiten aus den Ländern wie England, Frankreich und Russland.
-Alle Gespräche werden in einem dunklen verborgenen Raum in Form einer virtuellen Konferenz abgehalten.